1、填写纳税申报表并附送相关材料，纳税人需自行进行税收纳税调整并填写年度纳税申报表及其附表，向主管税务机关办理纳税申报。
2、税务机关受理申请，并审核所报送材料。若企业提供的材料齐全、无误，税务部门将确定企业当年度应纳所得税额及应当补缴的企业所得税款，或者对多缴的企业所得税款加以退还或抵顶下年度企业所得税。
3、企业主动纠正申报错误，纳税人于年度终了后四个月内办理年度纳税申报后，如自行发现申报错误，可根据《企业所得税汇算清缴管理办法》等法律的相关规定向税务机关主动申报纠正错误，税务机关将据此调整其全年应纳所得税额及应补、应退税额。
4、企业结清税款，企业需根据主管税务机关确定的全年应纳所得税额及应补、应退税额，在年度终了后4个月内清缴税款。纳税人预缴的税款少于全年应缴税款的，在4月底以前将应补缴的税款缴入国库；预缴税款超过全年应缴税款的，办理抵项和退税手续。
至此，企业所得税汇算清缴工作流程基本完成。
温馨提醒：因特殊原因不能按期缴纳税款的，纳税人应当在缴纳税款期限届满前向主管税务机关提出申请，以获得延期缴纳税款批准，但最长不超过三个月。
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