1、票据数量不一样，处理的难易程度也不一
无论是一般纳税人代理记账还是小规模纳税人代理记账，都是需要做账的，而做账最基本的就是各种票据。而一般纳税人由于营业额较高，所以涉及的票据通常也比小规模纳税人多。
而且一般纳税人涉及到增值税专用发票的进项票的认证和抵扣，操作较为复杂。很多细节需要跟客户确认，因此代账公司通常会提供上门取送凭证的服务。
2、报税流程不一样报税次数也不一
对于企业来讲，税务报道很重要。小规模纳税人的增值税是按季申报的，而一般纳税人是按月申报的，光一个增值税，申报次数就翻了四倍。
而且，每次要填写的申报表也多了很多。还以增值税为例：小规模纳税人就只需要填写：增值税申报表、申报表附列材料和免税申报明细即可。如果是零申报，那就更方便了。
但若是一般纳税人：一般纳税人除了每月申报之外，月初还要及时抄报税，月底要及时认证进项票，然后还必须控制税负：缴的税太多，客户不高兴了；缴的税太低，税局又不愿意了！
3、记账做账的标准不一严格程度也不一
一般纳税人代理记账与小规模纳税人代理记账在做账方面区别也很大。
一般纳税人在做账要求比较高，代理公司会要求客户一定要每个月及时提供银行对账单、工资明细、各种入账单据等等，而且要设置明细核算。
不论是小规模纳税人还是一般纳税人，记账、报税两大环节必不可少。不过纳税人身份不同，记账要求，报税都是不一样的。一般纳税人记账要求较高，需要处理账务问题也较多，所以代理记账费用要比小规模贵一些。
